以努尔哈赤的本意，是想在完全入冬之后，无须再放牧和狩猎之时再进攻明军所占领的辽东地区，但是今年对女真人的天灾的进一步加深使得他不得不决定早上几日出兵了。在今年春季时，金国的大片地区都受了干旱，无数的牛羊等牲畜无法成活，现在刚进了冬季，气温就骤然下降，又一次冻死了许多没有丝毫准备的牧人的牛羊。

两次灾劫同时爆发，终于使得金国再也坚持不下去了，在下面各部落的酋长集体进言，再加上其他带兵的将领一致要求下，努尔哈赤终于决定攻打辽东，将自己遭受到的灾难转嫁到汉人百姓的身上。而之前大败而回的那几千人马也带来了一些消息，使他知道了锦州如今的局势，明白现在攻打锦州城是个恰当的时候。

这次努尔哈赤决定动用举国的兵力，只有这样才能获得一场大胜。但是因为女真各部落的人马因为各自放牧的关系并不在一起，所以想要将人马都聚集起来也要花上一些时间，而女真人又不愿意再干等下，所以最终他决定让自己最为信任的儿子——皇太极带五万精锐攻向锦州城。最好是在他将其他各旗人马都会聚一起时，能直接进驻锦州城中。

这五万人马其中有努尔哈赤最为看重的正黄旗的人马，也有当日阿敏战败后被迫交出的镶蓝旗的人马。前者是拱卫大汗以及都城沈阳的金军中为强者，而后者却是一心要洗刷之前战败的耻辱而同仇敌忾之人。有了这两支无论是士气还是战力都极其高涨的人马在手，皇太极对此次攻打锦州城也是充满了信心。

五万金兵一路南下，发现原来还想对之发起突袭，使之无法向锦州城示警的要塞堡垒之中居然空无一人，这让皇太极大为错愕，然后便是大喜：“哈哈，明军居然只守在锦州城一地，我们想要取下它来就更为容易了！”他立刻就下令人马全速前进，务必在明军还没有发现自己到来之前就兵临锦州城下。这命令也正合想要洗刷耻辱和一心立功的所有人马的心意，五万骑兵在换乘着坐骑的情况下，以最快的速度杀到了锦州城下。

一切真如袁崇焕所担心的那样，因为没有了前面的关隘回报军情，所以当守城将士看到突然杀到的大量金兵，就立刻慌了神了。他们毕竟不是孙承宗培养出来的辽东的原有驻军，虽然曾上过沙场但却还没有遇到过如此声势的骑兵队伍。所以他们很明智地选择了死守在锦州城里，然后一面点燃烽火以求救，一面还派出了轻骑往后去求救。这却放过了一个唯一能将战事的主动权掌握在自己手里的机会，没有趁着敌人立足未稳的时候先攻他们一个措手不及。

不过也好在这些将领的胆小，所以才没中了皇太极的计。作为金人中最善于用智谋破敌的人，皇太极不可能犯下这么大的错误，他在扎下营来时，已经在左右两边埋伏下了不少的人马，一旦明军出城来战的话，恐怕就要落进他的陷阱，受到不小的损伤了。

可是众金兵在准备了一夜之后却没有明军出城来攻，这让所有人都觉得有些莫名其妙了。就他们所知道的军报来看，守城的明军人数当在三万人间，有这兵力是足够与自己一战的，怎么对方却只是龟缩在城里呢？皇太极得出了两个推论：一是明军的将领看穿了自己的策略，不敢冒这个险，二就是对方没有胆量出城一战。

无论是哪个原因，皇太极都认为这是明军胆怯的一种表现了。所以在让众人歇息了一夜之后，他便立刻发起了对锦州城的攻击。他要在努尔哈赤带着人马来到之前，取下锦州城，这样才不枉父亲将先锋重担交托给自己。

不过这锦州城的坚固还是出乎了金兵的预料，他们虽然连踏蹶箭这等攻城的利器都用了出来，但是城中的守军却依然能紧守门户，不让金军有一丝的机会。围城三日，金兵已经战死了近千人，但是攻上城头的次数却是寥寥可数。而那为数不多的几次攻上城去，都被城上所布的火枪兵给硬生生地打了回去，反而折损了好些人马。

不过这也是因为皇太极不肯将所有的兵力都放进去的缘故，如果他肯如阿敏一般将所有人马都投放了进去的话，只要四面城墙同时攻打，明军就难免顾此失彼。可是他却不是阿敏这样的只知逞一时之快的人，他清楚虽然攻下锦州城很是重要，但是却也不能有太大的伤亡，不然下面的城池想要攻下来就难了。而且他也吸取了之前阿敏战败的教训，为了防止明军的援兵突然杀来，他总是将大半的人马留在中军大营里，只派了一万五千人轮流进攻城池。