5月2日，中国海军南洋分舰队炮击了爪哇岛东部重镇泗水，并掩护苏门达腊民团实施登陆作战，于当天控制泗水，至此，荷兰在爪哇岛的殖民统治土崩瓦解。同日，中国陆军局部动员，首批陆军部队由广州登船，前往海南岛。

同一日，日本海军舰队进攻马鲁古群岛，并出动飞机轰炸了岛上荷军兵营。

面对中日两国军队的夹攻，荷兰东印度殖民当局已完全无法控制当地局势，婆罗洲、马鲁古、锡里伯斯、安汶等地区陆续爆发土著民暴动，荷兰对东印度群岛的殖民统治已呈土崩瓦解之势，东印度群岛的动荡局面进一步波及到了整个东南亚地区，马来亚、菲律宾、法属印支殖民地、英属缅甸殖民地均发生了反殖民暴动，虽然很快被殖民军镇压下去，但是“亚洲独立”的呼喊正随着南洋战火的熊熊燃烧而高涨，受此形势影响，在欧洲西线与德国军队作战的印度军队中出现“印度独立”的呼声，并影响到了军队士气，随后不久，由于法国军队中厌战情绪蔓延并进而导致兵变，协约国西线攻势大减，德国军队趁机反攻，西线战局一度岌岌可危，英国远征军甚至已制订了协助法国军队保卫巴黎的巷战作战方案。

南洋战争牵动欧洲西线战局，欧洲西线战局牵动英国、法国政局，在岌岌可危的形势下，英国、法国只得继续向荷兰政府施加外交压力，迫使荷兰政府尽快接受现实，接受中国、日本政府提出的和平条件，以期尽快结束东南亚的动荡局势。

5月6日，荷兰王国政府宣布接受英国、法国、美国、俄国调停建议，单方面宣布在东印度群岛战区实现停火。同一日，暹罗（泰国）政府向荷兰政府递交外交备忘录，要求荷兰东印度殖民当局加强对当地暹罗侨民的保护力度，不然，暹罗政府将“采取必要措施保护本国侨民”，与此同时，暹罗海军的两艘驱逐舰出现在婆罗洲近海，不过很快就被美国军舰驱逐。

5月7日，中国宣布接受荷兰停火倡议，在苏门达腊、爪哇战区实现停火，次日，日本也宣布接受荷兰停火倡议，在已占领地区实现停火。

5月9日，中国、日本、荷兰三国代表在瑞士日内瓦举行正式会晤，讨论结束南洋战争事宜。

同一日，暹罗（泰国）发生政变，政府倒台，亲德派政府官员被关押进兵营，英国、法国殖民军队随即宣布“应邀”进驻暹罗首都，帮助维持局面，当天，暹罗政府即宣布加入协约国集团，参加对德战争，次日，中国、日本政府分别发表政府公报，宣布不承认暹罗新政府之合法性，要求政变者立即释放被囚禁的政府官员，与此同时，两国也宣布，暂时停止日内瓦会谈，恢复在南洋战区的“自由行动”，受此要挟，英国、法国政府只能“建议”暹罗新政府释放被关押的旧政府官员，随后，在英国军队的保护下，这些人前往中国、日本使馆，并最终前往香港。

5月11日，美国海军派遣陆战队登陆婆罗洲，以武力保证这一地区的中立，并在荷兰殖民军前往镇压土著民暴动时维持沿海补给站的秩序。

5月15日，荷兰政府宣布完全接受中国、日本的和平条件，同意由远东和平委员会决定苏门达腊、爪哇、马鲁古、新几内亚、锡里伯斯等地区未来的政治地位，作为交换，中国、日本也“在原则上”承认荷兰对婆罗洲等地区的“实际控制权”。

同一日晚些时候，中国、日本、荷兰三国代表与英国、法国等中立国代表正式在瑞士日内瓦签署和平协议，宣布结束南洋地区的战争状态。

至此，南洋战争结束，相比在欧洲进行的那场漫长的战争，这场南洋战争确实是一场“快速战争”。

远东地区终于平静下来，欧洲各国长嘘口气，然后，又全神贯注的投入到那场据说可以终结一切战争的欧洲战争中去了。