申时行与其他那些官员最大的不同，不在于他是首辅，地位高了一大截，而是在于申时行从皇帝还在做太子时就担任其“同知经筵事”，对皇帝的了解远超同派系内的其他官员。
同知经筵事，简单类比一下就相当于后世的副班主任。太子殿下当时的“班主任”是高拱和朱希忠——当武兼备而设置，实际上朱希忠只是挂名而已，真正的“班主任”是高拱。
可是，彼时的高拱作为内阁首辅，又兼着吏部尚书，光是政务的处理就已经无比繁重了，哪里还真的能够履行多少“知经筵事”的职责？他了不起也就是掌握一下大方向，实际工作基本都只能丢给时任礼部侍郎的申时行。
换句话说，申时行当时就是“副班主任代理班主任”，是对朱翊钧最为了解的“帝师”。
在朱翊钧的思想动态、行为习惯等方面的掌握上，天底下能排第一的人是高务实，而紧随其后的就要属他申时行了。
朱翊钧用人的习惯，不惟高务实一人了如指掌，他申元辅同样心知肚明。对于自己信任的臣子，朱翊钧任何时候都“很好说话”；对于信任的臣子要办的事，他也能够全方位的给予支持——除非在这种支持力度之下你都能把事办砸，但那就是另一回事了。
具体到高务实这次的事情上，朱翊钧本身就很可能会表示支持，因为高务实的这个户部尚书本来就是他亲自“宸断”并提出的，内阁及九卿的廷议实际上只是“补票”，所以此时想劝他出面拦住高务实就已经很不容易了，申时行“就事论事”的奏疏就是为此而上。
但偏偏这些官员不知轻重，甚至还找错了突破口。
以朱翊钧对高务实的信任程度，你污蔑高务实什么玩意不好，你要污蔑他谤君？
哦，你说你弹劾的是高务实毁谤后来的皇帝而非今上，那我倒要问一问了，后来的皇帝是谁啊？皇上现在连太子都不肯立呢，你指望皇上现在会关心这茬？
更何况，高务实现在的职务是什么？
户部尚书？对，没错，但是……还有呢？
他是太子太师啊！你们就这么不把加衔当乌纱帽看吗？
人家是太子太师，连批评太子都是职责所在、分所应当的正经事，奏疏里提一句担心皇子们将来教育成效的话，这有什么问题吗？
这个世界上有很多话，甲能说而乙不能说，这再正常不过了。就好比你是当爹的，你谦称自己的儿子为“犬子”自然无可指摘，但倘若别人跑来说你儿子是“犬子”，你不要气得想打断他的腿？
所以，高务实顶着太子太师的帽子说这句话根本没有问题，如果非要说有，那也只能是在他完全失去圣眷之时才能说，因为那种时候就好比严嵩倒台之前——皇帝已经腻歪了，根本不想再看到他。
可是，高务实失去圣眷了吗？皇帝腻歪他了吗？
没有。不仅没有，事实上从皇帝亲自宸断任命他为户部尚书这件事就看得出来，皇帝对他的依赖程度其实反而更高了。
申时行很清楚自己作为心学派当代党魁的压力来自哪里：年轻的皇帝陛下一门心思要完成二祖列宗未尽的事业，覆灭残元，消除北疆最后一点军事威胁，混一寰宇，处中国而治万邦。
然而要达成这一目的，最重要的事情归根结底其实就两点：军力和财力。
军力不止是兵力，还包括装备、士气、训练、将领、后勤等各个方面。纵观大明，在这些要求上最为符合标准的无非就是宣大、蓟辽这“京畿两翼”，而在这两翼的精华之中，除了一个李成梁所部之外，几乎全是高务实的嫡系或者旁系势力。
再加上高务实本人经过数次大战的胜利，早已战功彪炳、威名赫赫，“大决战”不用他用谁？难道皇上会用我申时行去带兵不成？
甚至可以这样讲：皇帝如果不派高务实去打这一仗，指派谁去都必然会有人不服，甚至那个人自己都未必敢接这道旨意！
文官的“望”可以养出来，但文帅的“望”，那是只能打出来的！
昔谢安说“小儿辈已破敌”的时候好像很镇定，可是当朋友惊喜而去，他自己出门的时候居然在门槛上绊了一下差点摔跤，待站稳之后便仰天长笑，喜极而泣。
说明什么？说明以当时谢安的地位和威望，在没有一场决定性大胜在手的时候，自己心里都不是那么托底啊！只有当这场大胜稳稳当当拿到手了，才算是真正成了东晋王朝的擎天白玉柱，架海紫金梁。
然而高务实呢？他在大明虽臣中的威望，肯定还是比不过当时的谢安。然而，如果只是单说用兵这一块，他却比淝水之战前的谢安更让人有信心。
扪心自问，哪怕是他申时行，也信得过高务实的用兵之能。作为最大的“反对派”都是如此，其他人自不待言。
所以，在“军力”这一要点上，皇上对高务实必然是寄予厚望的，用此前数次高务实被劾之后皇上安抚他的话来说，那就是“朕深倚之”。
本来，有这么一个要点被高务实占据，他的地位就已经非常稳固了，古人云“兔死狗烹”、“鸟尽弓藏”，如今兔没死、鸟未尽，高务实的地位根本不可能动摇，这就已经让申时行觉得非常棘手。
可更麻烦的事情出现了：皇上认为高务实不仅是在打仗方面无人能及，于理财一道也是同样厉害，所以当目前的最大的麻烦由军事转为理财之后，居然又抓住机会“以爵赏换晋升”，把年仅二十五岁的高务实直接推上了户部尚书这个要害位置上。
平心而论，其实申时行也觉得高务实在理财方面肯定是很有一手的——这是屁话，看看人家的京华就知道那不是有“一手”，那是有“圣手”啊！
不过，多年来的固定思维还是让申时行有一种怀疑，即高务实的手段用来“齐家”或许没有问题，但用来治国却并不一定那么可靠。