后，孙可望留下艾能奇镇守合肥，监视朱聿键，自率大部分隆武军精锐北上前往凤阳。

在那里，孙可望增修城墙，兴建侯府，储蓄粮草，四处招兵买马。他对明廷完不信任，只是想建立属于自己的独立之地。

此外，孙可望还打着共同抗击满清的名义派人前往济南，希望和周显保持良好关系。而且特意把这样的消息透漏给南明那边，借机讨要更多的钱粮。

这明显触动了南明敏感的神经。

朱聿键虽然是名义上的唐王、大将军，但完指挥不动孙可望和他手下的大军。再加上他对朱慈烺所领导的南明朝廷也不完信任，而且心中还存有一点帝王的心思，也拒绝了南明向江淮派兵的请求。

这样造成的结果是南明虽然名义上收降了隆武军，但却完控制不了江淮，甚至连明军都进入不了江淮。

反而因为收降了隆武军，每年都需要向之提供大量钱粮。

再加上收降闯军的军饷和辎重，明廷新建的十团营的耗费，南明朝廷面临着前所未有的财赋压力。

为了解决这个问题，也为了稳固南京的防守，更因为对周显的不信任，南明朝廷内的主战派占据了优势。

锦衣卫指挥使马吉祥在史可法的默许下，下令在扬州内隐藏的锦衣卫鼓动扬州漕丁作乱。

邵宗元下令打开扬州南门，张名振手下将领阮进率六千精卒以平叛的名义进入扬州城中，袭取了府衙及粮库，同时接管了城内的盐场和钱庄。

因为明军对此事做的十分隐秘，又及时封锁城池，等安插在镇江城内的细作把张名振大军出动的消息传到扬州之时，时间已经太晚了。

而且，城内只有千余周显军，面对数倍之敌，也显的无比势单力薄。

守备裴守政下令放弃城内其他地方，军退到北门固守，同时派人紧急向在高邮城的驻军求援。

得知消息的阮进欲要强攻北门，但被张煌言出言阻止。

扬州本为双方共有，增兵甚至夺取扬州，或许将来和周显还可相谈。若攻杀周显军士卒，那事情就再无转圜的余地。

而且这样一来，平定叛乱的理由也不再有用，在大义方面对朝廷有亏。

张煌言建议以重兵将城内周显军堵在北门，隔绝其水粮供应，派人前去劝降他们。若他们不愿归降，可放任他们自由离开。

只要得了扬州城，对大明来说这次出兵就是值当的。

之后张名振率更多士卒到达，他也赞同张煌言所说的，但也认为不可不做防备。他派出三千水卒进驻扬州之北的邵伯镇，封锁了淮水到长江的入口。

同时，张名振又传信郑鸿逵，请其率一部水师移驻镇江，以防不测。

唯一出乎明军意料的是周显军的反应速度。

在明军突入扬州城的第二天，驻守高邮的参将陈王信便率五百骑卒，三千步卒，直杀到扬州城下。在明军还未隔绝扬州内外联系之前，与城内守军成功会和。