邴原与华歆、管宁三人，因才华出众被称"一龙"：华歆为龙头，邴原为龙腹，管宁为龙尾。又因管宁那个"割席断义"故事，使管宁与邴原的高尚节操著名于世。当地州府征召他俩出任官职，但皆被邴原、管宁婉拒。

公元184年，黄巾起义爆发，朝廷及黄巾双方，都欲招纳能人贤士为自己阵营服务。邴原就将家属悄悄安置在北海城内，自己则避进了郁洲山中。

其时孔融担任北海相国，听说邴原居于郁洲山中，就举荐邴原为有道，类似时下组织部门负责干部选拔的部长。邴原不去，又认为黄巾乱军势力兴盛，擅文缺勇的孔融难以应对，自己继续留在北海，恐难再保安全，于是前往辽东郡，从而得以与富有勇略雄气的刘政相好。

辽东郡太守公孙度，因畏惧刘政的勇猛而想杀死他。刘政闻讯出逃，公孙度就将其家人俱捕入狱，同时通告各县："敢有窝藏刘政者，与其同罪。"刘政无处可匿，便去投奔邴原。

邴原窝藏了刘政一个多月，后知避居辽东的东莱人太史慈准备返回中原，便去找他，要求太史慈想法将刘政带出辽东郡，太史慈应允。等到刘政走后，邴原便去找公孙度，说："将军前些日子要杀刘政，是怕他祸害辽东郡，现在他走了，应该不会再害辽东郡了吧？"

公孙度答："确实是这样。"

邴原就趁热打铁："既然这样，将军又何必继续拘押刘政的家人呢？不如赦免他们，没必要结一仇怨。"公孙度便放了刘政家人，邴原又出资送他们出了辽东郡，与刘政团聚。

因于邴原学问精深，加上情操高尚，短短一年时间，就有几百户人家迁居到他的住地附近，游学的士人，求学的孩童，施技的教授，穿梭往来，络绎不绝。

后来，辽东郡的治安开始不尽如人意，邴原便返回北海。其时孔融已经依附曹操，听说邴原已回，曹操征召他为司空掾。

公元208年，曹操的爱子曹冲突然病逝，曹操伤心欲绝。纯属凑巧，邴原的女儿也在这个时候病死。曹操得知，要求邴原将其女儿与曹冲合葬，意为阴配婚姻。邴原推辞说："合葬之举，不符礼仪。邴原之所以追随明公，明公之所以接纳邴原，是因为我与明公都能遵守规章制度。如果我这次听从明公之令，就说明我变得平凡庸俗了。将一个懂理懂礼的学者，变成一个俗人，明公认为这事值得去做吗？"曹操于是打消这个念头。

两年后，曹操调邴原为丞相征事。对于邴原在征事任内的政绩，时任曹魏东曹掾的崔琰，曾在自己推荐官职的奏记里叙述："征事邴原、议郎张范，都秉赋德行纯正美好，志向行为忠正端方，清廉洁净足可以激励凡俗，坚贞自守足以求取事功，正是所谓龙凤的羽翼，国家的重宝。推举任用他们，将使不讲仁德的人远遁。"

曹操每次出征前，常嘱曹丕："有事就向邴原与张范讨教。"正争世子之位的曹丕，便对邴原与张范执子孙礼。

有次曹丕宴请宾客，酒酣之时，他出了道难题："君主和父亲各自都有疾病，救命药丸只有一粒，是救君子还是救父亲呢？"宾客为表忠心，都说救君主，惟独邴原一言不发。曹丕追问邴原："你将药丸给谁？"

邴原答道："父亲！"曹丕倒也没有为难邴原。

不久，邴原代替凉茂的长史一职。自此之后，他闭门自守，非公务从不出门。公元214年，曹操征讨孙权时，邴原随军，不幸病逝途中，具体卒日不详。